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◆ FAT32使用限制說明
1. 32GB的容量限制：FAT32原理上可達約8TB的容量，但是微軟的作業系統與磁碟分割工具都會限制只能分割32GB的磁區，想要分割與格式化超過32GB的FAT32磁區，您必須使用第三方廠商的工具軟體，例如：Spfdisk、Gdisk或Partition Magic等，或改用NTFS格式。雖然有此限制，但系統仍然可以讀取超過32GB的FAT32磁區。
2. 磁區無法小於32MB：由於FAT32最小叢集（Cluster Size）的限制，磁區分割不能小於32MB。
3. 單一檔案大小限制4GB：如果需要存取單一檔案超過4GB以上（例如高畫質影片或圖檔），請使用NTFS格式。
4. 在Windows 2K或更新的系統上，部分功能無法使用：Windows 2K或更新的系統都可以存取FAT32磁區，但系統的部分功能會無法使用，例如安全性設定、磁碟配額等。

◆ FAT16使用限制說明
1. 200MB的容量限制：FAT16原理上可達約4GB的容量，但磁區如果超過200MB，存取效率會明顯變差，因此磁區超過200MB建議改用FAT32或NTFS格式。
2. 檔案數量限制約65536個：FAT16的檔案數量上限不高，約65536個檔案，如果需要存取數量龐大的檔案，建議改用FAT32或NTFS的格式，否則即使磁區還有足夠的可用空間，仍會發生錯誤。
3. 單一檔案大小限制2GB：如果需要存取單一檔案超過2GB以上，請使用NTFS格式，如果檔案大小介於約在2GB~4GB之間就可以使用FAT32。
4. 在Windows 2K或更新的系統上，部分功能無法使用：Windows 2K或更新的系統可以存取FAT16磁區，但系統的部分功能會無法使用，例如安全性設定、磁碟配額等。
造訪微軟網站的知識庫取得更詳細的說明：（KB184006）FAT32檔案系統的限制或TechNet：How FAT Works（英文）。

◆ 使用建議
1. 內接式硬碟：除非要安裝Win98/95等舊系統，或是要讓這些舊系統能存取資料，否則以目前常見的Vista或XP系統來說，都建議使用NTFS的格式，才不會遇到磁區、檔案大小或檔案數量等限制。
2. 外接式硬碟：由於外接式硬碟為了能同時支援舊系統或其他系統（例如Mac或Linux），預設最常使用的格式是FAT32，因此很容易遇到檔案大小超過4GB就會存取錯誤的問題，所以使用時請記得單一檔案不能超過或接近4GB，如果想要存放單一檔案超過4GB，建議您使用NTFS格式。
3. 記憶卡：目前的記憶卡容量也是越來越大了，因此許多人會使用記憶卡來存放大容量影片或數量龐大的照片，但問題是記憶卡常使用FAT32或FAT16的格式，就會有檔案大小與數量的限制，最常遇到的狀況就是記憶卡使用FAT16的格式，無法存放單一檔案超過2GB或檔案數量超過65,536個，特別是用在攝影或照相的記憶卡最容易超過限制。由於相機、攝影機或手機會限制記憶卡使用的格式，因此您無法隨意使用其他格式來解決，雖然一般相機在設計上也會事先預防或提醒，使用時仍要多留意。

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